Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG0

Slc30a8, Zinc transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a8Q8BGG0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Slc30a8Q8BGG0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Slc30a8Q8BGG0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc30a8Q8BGG0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc30a8Q8BGG0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc30a8Q8BGG0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms