Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krr1Q8BGA5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krr1Q8BGA5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krr1Q8BGA5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krr1Q8BGA5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms