Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms