Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms