Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms