Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms