Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ChfrQ810L3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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