Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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