Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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