Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms