Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms