Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2bQ80XK6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms