Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Catsper3Q80W99 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper3Q80W99 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms