Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms