Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc29Q80VM3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc29Q80VM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc29Q80VM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc29Q80VM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc29Q80VM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc29Q80VM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc29Q80VM3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc29Q80VM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms