Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW3

Rinl, Ras and Rab interactor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RinlQ80UW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RinlQ80UW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RinlQ80UW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms