Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NischQ80TM9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NischQ80TM9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NischQ80TM9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
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