Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms