Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms