Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HhipQ7TN16 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HhipQ7TN16 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms