Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms