Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpl35Q6ZWV7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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