Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp2r2bQ6ZWR4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms