Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms