Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nemp1Q6ZQE4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms