Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Efr3bQ6ZQ18 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efr3bQ6ZQ18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms