Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms