Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80Q6ZPV2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80Q6ZPV2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms