Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnt1Q6ZPR4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnt1Q6ZPR4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms