Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms