Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms