Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rhox8Q6VSS7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rhox8Q6VSS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms