Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc154Q6RUT8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms