Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms