Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn2Q6PHP6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Lrrn2Q6PHP6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Lrrn2Q6PHP6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms