Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a7Q6PGE7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms