Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SvoplQ6PDF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SvoplQ6PDF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms