Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PD19 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PD19 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PD19 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PD19 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms