Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx6Q6P8X1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms