Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms