Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Podnl1Q6P3Y9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms