Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrimpolQ6P1E7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrimpolQ6P1E7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms