Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asic1Q6NXK8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms