Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms