Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ParpbpQ6IRT3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms