Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg9bQ6EBV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms