Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc2Q69ZB8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms