Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CltcQ68FD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltcQ68FD5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms