Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms