Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms